O PPGHIS vem colaborando sistematicamente com periódicos importantes. As professoras e professores, bem como estudantes e demais pesquisadores do programa atuam na qualidade de editores, membros do conselho editorial ou nas atividades de apoio das seguintes revistas: Revista Brasileira de História, História da Historiografia, Almanack, Clássica e Revista Eletrônica da Anplhac.
A participação nas revistas aponta a inserção destacada do programa na área. Assim, atualmente, o Prof. Valdei Araujo ocupa a posição de editor-chefe da Revista Brasileira de História; o Prof. Fabio Faversani integra o conselho editorial da Clássica, revista publicada pela Sociedade Brasileira de Estudos Clássicos; a Prof. Luisa Rauter Pereira e o Porf. Mateus Pereira atuam como editores da História da Historiografia, revista publicada pela Sociedade Brasileira de Teoria e História da Historiografia; e a a Prof. Claudia Chaves atua como editora da revista Almanack, sediada na UNIFESP.
Duas destas revistas contam com apoio institucional regular do PPGHIS através dos editais internos de apoio à publicação com recursos PROAP/CAPES: História da Historiografia e Almanack.